Aklimatisasi merupakan tahap terakhir dalam proses kultur jaringan anggrek. Aklimatisasi sering menjadi kendala bagi beberapa pemula. Hal ini disebabkan mereka kurang peka mengamati kondisi kesehatan dan kesegaran anggrek yang sedang di aklimatisasi.
Dalam proses aklimatisasi anggrek sebaiknya digunakan media tanam yang halus dan lunak, sehingga akar bisa tumbuh optimal. Hasil proses aklimatisasi ini akan lebih baik jika media yang digunakan disterilisasi terlebih dahulu. Kelembapan media harus stabil sekitar 80%. Karenanya, selama proses aklimatisasi, bibit anggrek yang baru tumbuh harus diberi naungan secara bertahap sampai bibit anggrek benar-benar kuat untuk di buka penuh setiap hari.
Unsur hara sebaiknya diberikan secara lengkap dengan dosis rendah dan dicampurkan dalam air penyiraman. Sebaiknya air penyiraman jjuga diberi fungisida dan bakterisida.